Detail information of JCDBG25283

JCDBG25283
ID
JCDBG25283
Name
LOC105650692
Type
protein_coding
Scaffold
NW_012130064.1
Start
829033
End
835337
Strand
-
Link
Genbank id:105650692 | Jatropha Genome Database ID:Jcr4S15788.10
Molecular function
GO:0005524 | ATP binding
GO:0004672 | protein kinase activity
Cellular component
Biological process
GO:0006468 | protein phosphorylation
KEGG
K11866
Source
Gnomon
TF
Description
putative
Sequence
aattgatttttcttcaatGTTATTTGGGTGCTGAAAGTTCAAACCAAACATAAAAACCCAGAGTCAACTACTATAATAAC AATCGCTAACAGCAAACACACAACTACTCCATTCGATGTCTTCCACGCTGGTTGTCTTTTTTTGATTCTAAGCTGAACAA ACTGCTATCAATAAACCTGGACGAAGATtctccaccaccacctccataTCAGGGCGGTGGTTTATCTGATGCCTTGATGG GCCTTCTCTCCAATTTCTGCGGCTGCCTGGAGAAACTCAAATTCGCCCGAGCCACTGGTACAGGCGGCGACGATGACGAC GCTAACACTAATGACCTCTTCTTCGACCTCCGCACGCTTCAAGTCGCTACCAATTTCTTCTCAGAGTCGAATCAGCTTGG TCATGGAGGATTCGGTCCTGTTTACAAAGTAAGTTTTCGCTAACTCATTGGCTTCATTACTTCAACTGTAGAACATTGGA TTCGTATCTCGCATTTTCCGTGTATGGCCGGAGGTTTTTCTTAGTAATAAATTTACTGAAGTAGCCTTGGAGTTGCTGAA ATGTTTACGGAAGTGgtttaaaatatagaatgaAAACATCTTCCGTTTACAGTTGGCATTTTCCCAgtcaaatgcaaata taaaacatgATAGTTATGTTAACATAATACGTTAGTTGtgactaaaaattatttaaaaaaaaaaaaaattcaatgccGTT TTAAATAGGAAGTCATTTGAAAGGAAATCTAAAGTTTGATTTAGAGCTCCATATGGAACTTTTCCTCCTTTGATGAAGga tattgtttttctttttctttttatatttggaaCAATTTGTCCCCATCAACAACAATTTCATGACACAATTATCGTTTCTT CTAATTAAATGAACTATGCAAATAAATTACTGACCCTTCTTTTATGCGTGTGTCCTAGTAATGTGAATCATGCATGGGAA 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Gene structure

JCDB Genes gff download

JCDBG25283 's gene expression heatmap with it's positive (above) and negative (bellow) co-expressed neighbours

Mouse click the small gray square will display sample information.

JCDBG25283's gene network (protein-protein interaction & gene co-expression among this gene and its Top10 neighbors)   

Node color:
Pumpkin: this gene;
Macaroni And Cheese : co-expression gene;
Forest Green :protein-interacting gene ;
Edge color:
Pelorous: co-expression;
Turquoise Blue HueBlue : protein protein interaction;

co-expression network
node1node2typescc
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PPI network
node1node2type
JCDBR33771
ID
JCDBR33771
Name
XM_012237637.1
Type
Scaffold
NW_012130064.1
Start
829033
End
835337
Strand
-
Exon
829033-829644,830343-830493,830590-830827,830943-831153,834911-835337
Sequence
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Product
putative receptor-like protein kinase At4g00960
Source
Gnomon
Link:
Dbxref=Genbank:XM_012237637.1
JCDBP29702
ID
JCDBP29702
Parent
JCDBR33771
Name
XP_012093027.1
Scaffold
NW_012130064.1
CDS
829234-829644,830343-830493,830590-830827,830943-831153,834911-835102
Strand:
-
Sequence
MGLLSNFCGCLEKLKFARATGTGGDDDDANTNDLFFDLRTLQVATNFFSESNQLGHGGFGPVYKGLIPNGQEVAVKKLSL TSRQGLREFTNEVKVLLKIQHKNLVTLLGCCVEGPEKMLVYEYLPNKSLDYFLFDKQKSASLDWTTRFRIVTGVARALLY LHEEAPERIIHRDIKASNILLDEHLNPKISDFGLARLFPGEDTHLDTFRISGTHGYMAPEYAMHGYLSVKSDVFSYGVLI LEIVSGRKNYDSQLGGEKADILTYTWMLHQQGRTLNLVDPTLTKCNHDEAAMCIQLGLLCCQQTVADRPDMNTVHLMLLS DSFTLPRPGKPGTHGRRGHFTTTGTSAFTNTNTNTNTNTNTNTVGSSMSIGVIAKVSGGSSFVEDYSRNSMSVSSMDEGR
Product
putative receptor-like protein kinase At4g00960
Source
Gnomon
Link
XP_012093027.1
InterProScan
IPR000719 Protein kinase domain
IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain
IPR008271 Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009 Protein kinase-like domain
Pfam
PF07714.13 Pkinase_Tyr Domain