Detail information of JCDBG25288

JCDBG25288
ID
JCDBG25288
Name
LOC105650727
Type
protein_coding
Scaffold
NW_012130064.1
Start
880284
End
883174
Strand
+
Link
Genbank id:105650727
Molecular function
Cellular component
Biological process
KEGG
K09015
Source
Gnomon
TF
Description
dihydroceramide
Sequence
tgaaagtaaaattacttttaagtGATTAcgtgaaaatatgaaataaaaaaaaaattcaaaaattcaaaaatagatGTACG CAATTCAATTAAATGGATTGACAATCAACatcaaattaaatgtaatGAAACTTCTACTTCTCAGGACTCTAACCTTGAGG CTTTAAATTGAGGatctaaaaattgaaagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagaaacaaCATTT AAACCTCAATTCTAAACTAGTTGGAGTcagttaaattaattctttacttCGTTTCATTCAGTTTATAGCTAACTGGCTTT AACTATAcatataaatgatgaattttttttaattaattaaccttTTGAAATGTATATATGACAGGTTGGTTACCTTGGAG AACATTATGATGGATGGGTTCACCAGCCTATTATAACAAAGGAAAGCCCTCGGTTTTTCCAGAGTGAGATTTTGGAGGta atgttatatataaatcatatttctttttgataattaacaattaatttcatctACCCTGTATGAGATGAAATGACAAAGAT CTCTTCTCCTTGATCAGAGATTTTGAGTTTAAGCTCTGgatatagaattcattttaatatttgggCGAAAAGCACTTTGG CCCTTTTAGGTCTGCTGAGCATGGATCCAGATTAGTCGAGCccgttaaaaaaaaaaaaatgattaacttttgttttttct ttttttgtttgagaACATACAGTGGGTGACTCGGTCAGTTTGGTGGGTAGTTCCAGTAATTTGGATACCAATGGCATGTT GGTGCATTTCCATTTCTATAAGAATGGGCCATTCATCTTCTAATGTAGCTTTAATGGTGGTTTTTGGGATTTTTGTTTGG ACATTTCTCGAATACCTTTTGCACCGCTTCCTTTTCCACTTCAAAACTAAGACTTACTGGTAAGTTTCTcttatttctta atatgaGTAATGCATAACTGtttaaagaagagaaaagaaaggaaaagaaaaagaaaagaaaaactccaCAGTATAAATAT AAGATACTGAGTTTGGATGAACTAAAATGGGTTTGGTTAATTTAGGGGAAACACCATACACTATCTTCTTCATGGGTTGC ATCATAAGTTTCCGATGGATCGTTTTCGGCTTGTCATGCCTCCTTTAGCAACCGCTCTTTTCTCTCTGCTGGTATgcatt tctatatatatatatatataaatatatatatatttatttatttatttatttatgaaattcaactACTCTCagctaaattt tatttataaataaattttagaaagtagGTACATAAAATACATCGGTATTGAGAAAAACaattgctttatatatataattt aaaaatagataaatcaaaaaatatgttatttaaagaaaaacaaatatacGTTAACAAAACAcgaaagataataaattaaa tggaagaaataaaaagataaacagagaaatgaaaaaaaacagaacacaaaagataataaatgaaattgaagaaatgttta ttttcaattagCTCGACAAAGCCGAAGTcgaaaaaatgtttattttcatgttgTAGCCGCCAGTCTCAATCTTGATGCAA TGGTAGTTAAATACACGAATTATAGAAGAGTTGGTTTTTAGAAGGAGAGAATAAGTTGAACTGCAGATACATAATAGAGA AAGATATTGTGAAGACATaatagaaaatgagaaaaatagatattatatgttaattagaaactaaaaattatttttttaca attatctTAAACcacatattaattaatccatACTTGTGAAATACTATTTAACAACATCATccaatcaatattttacaaaa taaagtaaaaatattcaaaaatacaaataggTAGACGTggatagataaataaatacagagactattaattattaattaat taactaatattttcatgaaatatttaaaagtattATCCAATCaagaatttacaaaaataaaaataaagtttttataGATT AGGTTagattagatttcaaaattataaattatcattattatatgtaaatattaaattgaaaaaataaattaagttagcct atcacaataaaaaaaaaaagaaaattttcaaagatttctaaaagaagaaaaatagaatgctCAGCAAAAAAAGTGTCTTA AACTTTCTCTTTGGTTCAGCTTTcacacatacatatatatatatatataggttgaactaaatactttattttaaacccaa tttgtTGGTAAACACATCTACACATGATTAAATCAAAGCAAACTCTGATGTTATGTTAATAAAATGGACCGACTATAACG CACTatctaaaaactaataaaaaaaaaaagattattcaaatcttatattttaattgcatcggcaaaatattgatattaac TTTCCAGATAAatagttttcattaaaaaaaaattatttgataggCTCAATTAGATGAGCTTTGCCTTTGGAATATAGACA ACATAATTTTAATGTGATGGCAACTCAAACCCACCTGTGAAAGAGGCAAAGtccaataatataaaagtttttagcacatt ttgttttctttcataAAAACAAATGGTCCATGGAATTGCGTTTCCTTCAAAGTAGTTCAAAGTTATAATGATGTTCCACC CGTGTCCCAATTCCATACTGTATCCTCAAATCTATGTACAAGTACAACACAGTAAAATCATgttaaagattatttattta tttatttatttaaaactagtttttttttttggtttaatatcaatattttaatttaacattaatccAATTCAAATGGCCGC ATAtggtttttgagtttaattgagttagtcttaattttaaattttacaaatctATTAATATCAATTTGCATTAgccactt tttattttagt
Gene structure

JCDB Genes gff download

JCDBG25288 's gene expression heatmap with it's positive (above) and negative (bellow) co-expressed neighbours

Mouse click the small gray square will display sample information.

JCDBG25288's gene network (protein-protein interaction & gene co-expression among this gene and its Top10 neighbors)   

Node color:
Pumpkin: this gene;
Macaroni And Cheese : co-expression gene;
Forest Green :protein-interacting gene ;
Edge color:
Pelorous: co-expression;
Turquoise Blue HueBlue : protein protein interaction;

co-expression network
node1node2typescc
JCDBG25288JCDBG18313co-exp1
JCDBG25288JCDBG15650co-exp1
JCDBG25288JCDBG12018co-exp0.710229
JCDBG18313JCDBG15650co-exp1
JCDBG18313JCDBG12018co-exp0.710229
JCDBG15650JCDBG12018co-exp0.710229
PPI network
node1node2type
JCDBR33776
ID
JCDBR33776
Name
XM_012237668.1
Type
Scaffold
NW_012130064.1
Start
880284
End
883174
Strand
+
Exon
880284-880289,880669-880761,881027-881223,881370-881467,883083-883174
Sequence
tgaaagtaaaattacttttaagtGATTAcgtgaaaatatgaaataaaaaaaaaattcaaaaattcaaaaatagatGTACG CAATTCAATTAAATGGATTGACAATCAACatcaaattaaatgtaatGAAACTTCTACTTCTCAGGACTCTAACCTTGAGG CTTTAAATTGAGGatctaaaaattgaaagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagaaacaaCATTT AAACCTCAATTCTAAACTAGTTGGAGTcagttaaattaattctttacttCGTTTCATTCAGTTTATAGCTAACTGGCTTT AACTATAcatataaatgatgaattttttttaattaattaaccttTTGAAATGTATATATGACAGGTTGGTTACCTTGGAG AACATTATGATGGATGGGTTCACCAGCCTATTATAACAAAGGAAAGCCCTCGGTTTTTCCAGAGTGAGATTTTGGAGGta atgttatatataaatcatatttctttttgataattaacaattaatttcatctACCCTGTATGAGATGAAATGACAAAGAT CTCTTCTCCTTGATCAGAGATTTTGAGTTTAAGCTCTGgatatagaattcattttaatatttgggCGAAAAGCACTTTGG CCCTTTTAGGTCTGCTGAGCATGGATCCAGATTAGTCGAGCccgttaaaaaaaaaaaaatgattaacttttgttttttct ttttttgtttgagaACATACAGTGGGTGACTCGGTCAGTTTGGTGGGTAGTTCCAGTAATTTGGATACCAATGGCATGTT GGTGCATTTCCATTTCTATAAGAATGGGCCATTCATCTTCTAATGTAGCTTTAATGGTGGTTTTTGGGATTTTTGTTTGG ACATTTCTCGAATACCTTTTGCACCGCTTCCTTTTCCACTTCAAAACTAAGACTTACTGGTAAGTTTCTcttatttctta atatgaGTAATGCATAACTGtttaaagaagagaaaagaaaggaaaagaaaaagaaaagaaaaactccaCAGTATAAATAT AAGATACTGAGTTTGGATGAACTAAAATGGGTTTGGTTAATTTAGGGGAAACACCATACACTATCTTCTTCATGGGTTGC ATCATAAGTTTCCGATGGATCGTTTTCGGCTTGTCATGCCTCCTTTAGCAACCGCTCTTTTCTCTCTGCTGGTATgcatt tctatatatatatatatataaatatatatatatttatttatttatttatttatgaaattcaactACTCTCagctaaattt tatttataaataaattttagaaagtagGTACATAAAATACATCGGTATTGAGAAAAACaattgctttatatatataattt aaaaatagataaatcaaaaaatatgttatttaaagaaaaacaaatatacGTTAACAAAACAcgaaagataataaattaaa tggaagaaataaaaagataaacagagaaatgaaaaaaaacagaacacaaaagataataaatgaaattgaagaaatgttta ttttcaattagCTCGACAAAGCCGAAGTcgaaaaaatgtttattttcatgttgTAGCCGCCAGTCTCAATCTTGATGCAA TGGTAGTTAAATACACGAATTATAGAAGAGTTGGTTTTTAGAAGGAGAGAATAAGTTGAACTGCAGATACATAATAGAGA AAGATATTGTGAAGACATaatagaaaatgagaaaaatagatattatatgttaattagaaactaaaaattatttttttaca attatctTAAACcacatattaattaatccatACTTGTGAAATACTATTTAACAACATCATccaatcaatattttacaaaa taaagtaaaaatattcaaaaatacaaataggTAGACGTggatagataaataaatacagagactattaattattaattaat taactaatattttcatgaaatatttaaaagtattATCCAATCaagaatttacaaaaataaaaataaagtttttataGATT AGGTTagattagatttcaaaattataaattatcattattatatgtaaatattaaattgaaaaaataaattaagttagcct atcacaataaaaaaaaaaagaaaattttcaaagatttctaaaagaagaaaaatagaatgctCAGCAAAAAAAGTGTCTTA AACTTTCTCTTTGGTTCAGCTTTcacacatacatatatatatatatataggttgaactaaatactttattttaaacccaa tttgtTGGTAAACACATCTACACATGATTAAATCAAAGCAAACTCTGATGTTATGTTAATAAAATGGACCGACTATAACG CACTatctaaaaactaataaaaaaaaaaagattattcaaatcttatattttaattgcatcggcaaaatattgatattaac TTTCCAGATAAatagttttcattaaaaaaaaattatttgataggCTCAATTAGATGAGCTTTGCCTTTGGAATATAGACA ACATAATTTTAATGTGATGGCAACTCAAACCCACCTGTGAAAGAGGCAAAGtccaataatataaaagtttttagcacatt ttgttttctttcataAAAACAAATGGTCCATGGAATTGCGTTTCCTTCAAAGTAGTTCAAAGTTATAATGATGTTCCACC CGTGTCCCAATTCCATACTGTATCCTCAAATCTATGTACAAGTACAACACAGTAAAATCATgttaaagattatttattta tttatttatttaaaactagtttttttttttggtttaatatcaatattttaatttaacattaatccAATTCAAATGGCCGC ATAtggtttttgagtttaattgagttagtcttaattttaaattttacaaatctATTAATATCAATTTGCATTAgccactt tttattttagt
Product
fatty acid 2-hydroxylase 1-like
Source
Gnomon
Link:
Dbxref=Genbank:XM_012237668.1
JCDBP29707
ID
JCDBP29707
Parent
JCDBR33776
Name
XP_012093058.1
Scaffold
NW_012130064.1
CDS
880284-880289,880669-880761,881027-881223,881370-881467,883083-883174
Strand:
+
Sequence
MKVGYLGEHYDGWVHQPIITKESPRFFQSEILEWVTRSVWWVVPVIWIPMACWCISISIRMGHSSSNVALMVVFGIFVWT FLEYLLHRFLFHFKTKTYWGNTIHYLLHGLHHKFPMDRFRLVMPPLATALFCIWFLSLIELVLILNFTNLLISICISHFL F
Product
fatty acid 2-hydroxylase 1-like
Source
Gnomon
Link
XP_012093058.1
InterProScan
Pfam